nbconvert은 jupyter notebook 파일을 markdown 파일 혹은 html 파일로 변환해주는 프로그램입니다.

• https://nbconvert.readthedocs.io/en/latest/usage.html

설치

nbconvert 를 설치 한다.

1
2
3
4
5

# pip을 통해 nbconvert 설치
(env)$ pip install nbconvert

# conda를 통해 nbconvert 설치
(env)$ conda install nbconvert

사용

원하는 포맷을 --to 에 지정해서 변환한다, 지원되는 포맷은 다음 같다

• HTML, LaTeX, PDF,WebPDF, Reveal.js HTML slideshow,
• Markdown, Ascii, reStructuredText,executable script,notebook.

다음 같이 사용한다.

1

jupyter nbconvert --to FORMAT notebook.ipynb

nbconvert 로 markdown 변환 명령은 다음의 두가지 결과물을 생성한.

• notebook.md : markdown 파일
• notebook_files : markdown 파일에 포함되어 있는 모든 이미지를 모아놓은 폴더

1
2
3

(env)$ jupyter nbconvert notebook.ipynb
(env)$ ls
notebook.ipynb   notebook.html    notebook_files/

예

예를 들어 My_NOTEBOOK.ipynb 라는 jupyter notebook 파일을 markdown 파일로 변환한다면

1

(env)$ jupyter nbconvert --to markdown My_NOTEBOOK.ipynb

pyenv 에 doctor 명령이 생겼다.

• pyenv 설치 구성을 검증한다.
• python 버전을 빌드하기 위한 개발 도구들

doctor 명령을 사용하려면 시스템에 개발도구와 빌드도구가 설치되어야 한다.

준비

pyenv 의 시스템 빌드환경에 필요한 도구를 설치가 필요하다.

• https://github.com/pyenv/pyenv/wiki#suggested-build-environment

Ubuntu/Linux

1
2
3

sudo apt update; sudo apt install build-essential libssl-dev zlib1g-dev \
libbz2-dev libreadline-dev libsqlite3-dev curl git \
libncursesw5-dev xz-utils tk-dev libxml2-dev libxmlsec1-dev libffi-dev liblzma-dev

macOS

1

brew install openssl readline sqlite3 xz zlib tcl-tk@8 libb2

pyenv doctor 사용

1
2
3
4
5

$ pyenv doctor
Cloning /home/USER/.pyenv/plugins/pyenv-doctor/bin/.....
Installing python-pyenv-doctor...
Installed python-pyenv-doctor to /tmp/pyenv-doctor.20250327094025.5063/prefix
Congratulations! You are ready to build pythons!

기타

시스템에 빌드 도구가 설치되지 않으면 doctor 명령을 실행하면 다양한 에러를 낸다.

1
2
3
4
5
6
7

$ pyenv doctor
...
...
configure: error: GNU readline is not installed.
Problem(s) detected while checking system.

See https://github.com/pyenv/pyenv/wiki/Common-build-problems for known solutions.

Jupyter-lab 의 kernel 은 Jupyterlab 과 실행 환경과 직간접으로 연결을 해준다.

ipykernel 은 jupyter에 대해서 iPython을 제공한다.

ipython은 jupyterlab에 kernel을 통해서 python 혹은 virtualenv 의 개발환경을 제공한다.

kernel

jupyter-lab 을 실행하면 커널 launcher 화면에 kernel이 출력된다.

실행중인 커널은 사이트 바에서 확인 가능하다.

jupyter 명령으로 커널을 관리할 수 있다.

jupyter 명령

jupyter 명령에서 kernels 를 생성, 제거 관리를 할 수 있다.

현재 kernel 목록을 확인 가능하다.

1
2

$ jupyter kernelspec list
  python3    /home/user/.pyenv/versions/MyEnv/share/jupyter/kernels/python3

새 kernel 생성성

가상환경 TestEnv 가 있다고 가정한다.

TestEnv 의 python 환경을 jupyterlab 에서 사용하려면

해당 가상환경을 jupyterlab 커널에서 사용하게 하려면 커널을 생성해 주어야 한다.

그러기 위해서 ipykernel 이 필요하다

1

pip install ipykernel

ipykernel 로 새 kernel 생성:

1

python -m ipykernel install --name {MACHINE_NAME} --display-name "{DISPLAY_NAME}" --user

다음 명령에서 --user을 사용하면 사용자의 ~.local/share 공간에 커널이 추가 되고 사용자의 jupyterlab 에서 모두 사용할 수 있다.

1
2

$ python -m ipykernel install --name testenv_kernel --display-name "Test Env" --user
Installed kernelspec testenv_kernel in /home/user/.local/share/jupyter/kernels/testenv_kernel

kernelspec 으로 확인 할 수 있고,

1
2
3
4
5

~$ jupyter kernelspec list
Available kernels:
  python3           /home/qkboo/.pyenv/versions/3.12.8/envs/TestEnv/share/jupyter/kernels/python3
  testenv_kernel    /home/qkboo/.local/share/jupyter/kernels/testenv_kernel
(TestEnv) qkboo:~$

Jupyterlab 의 launcher 화면에도 새 커널을 확인할 수 있다.

kernel 제거

kernelspec uninstall 명령을 사용해서 사용자 커널을 제거할 수 있다.

1

jupyter kernelspec uninstall {KERNEL_NAME}

testenv_kernel 을 삭제해 보자

1
2
3
4
5

jupyter kernelspec uninstall testenv_kernel
Kernel specs to remove:
  testenv_kernel        /home/user/.local/share/jupyter/kernels/testenv_kernel
Remove 1 kernel specs [y/N]: y
Removed /home/user/.local/share/jupyter/kernels/testenv_kernel

— 참고 —

1. https://docs.posit.co/ide/server-pro/user/jupyter-lab/guide/jupyter-kernel-management.html

mamba 와 conda 는 서로 교체 가능한 파이썬 패키지 매니저이다.

mamba는 conda와 같은 사용방법과 동일한 환경을 이어받은 패키지 관리자 이다. conda & mamba 명령을 서로 거의 동일하게 사용할 수 있다. conda 의 패키지 채널을 그대로 사용할 수 있다.

1
2
3

mamba install ...
mamba create -n ... -c ... ...
mamba list

여기서는 micromamba를 사용해보려고 한다.

micromamba 는 mamba의 소규모 버전으로 독립적 실행 파일이다. 다만 mamba 와 micromamba는 환경 구성이 좀 다르다. micromamba는 mamba와 다르게 MAMBA_ROOT_PREFIX 환경 변수를 기준으로 패키지 관리가 시작되고 환경이 생성된다.

1. 설치
2. micromamba 사용
3. 가상환경 사용
4. Repoquery 명령
5. Uninstall
6. 참고

1. micromamba 설치

https://mamba.readthedocs.io/en/latest/installation/micromamba-installation.html

Linux, macOS, or Git Bash on Windows install with:

1

"${SHELL}" <(curl -L micro.mamba.pm/install.sh)

Windows 에서 설치

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18

PS> Invoke-Expression ((Invoke-WebRequest -Uri https://micro.mamba.pm/install.ps1).Content)
Downloading micromamba from https://github.com/mamba-org/micromamba-releases/releases/latest/download/micromamba-win-64
  % Total    % Received % Xferd  Average Speed   Time    Time     Time  Current
                                 Dload  Upload   Total   Spent    Left  Speed
  0     0    0     0    0     0      0      0 --:--:-- --:--:-- --:--:--     0
  0     0    0     0    0     0      0      0 --:--:-- --:--:-- --:--:--     0
100 9280k  100 9280k    0     0  3355k      0  0:00:02  0:00:02 --:--:-- 10.8M

Installing micromamba to C:\Users\student\AppData\Local\micromamba

Adding C:\Users\student\AppData\Local\micromamba\micromamba.exe to PATH

Do you want to initialize micromamba for the shell activate command? (Y/n): y
Enter the path to the micromamba prefix (default: C:\Users\student\micromamba):
Initializing micromamba in  C:\Users\student\micromamba
C:\Users\student\AppData\Local\micromamba\micromamba.exe
The following argument was not expected: -p
Run with --help for more information.

Update

1

PS> micromamba self-update

특정 버전으로 업데이트도 가능하다.

1

PS> micromamba self-update --version 1.4.6

micromamba 도움말.

1

PS> micromamba --help

2. micromamba 사용

micromamba의 가상환경은 micromamba activate /path/to/env 같이 활성화 시키는데, MAMBA_ROOT_PREFIX 환경변수를 기준으로 micromamba activate env 같이 사용할 수 있다.

현재 사용할 수 있는 환경을 출력.

1
2
3
4
5

PS> micromamba env list
  Name  Active  Path
--------------------------------------------------------------
  base          C:\Users\student\micromamba
                C:\Users\student\miniconda3\envs\myenv

micromamba 명령으로 대부분의 conda 명령을 동일하게 실행할 수 있다.

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10

micromamba info                          # 현재 micromamba 환경정보

# 설치한 패키지 목록
micromamba list ananconda                # Anaconda 정보
micromamba list python                   # python 패키지 정보

# upgrade
micromamba update pip                    # pip upgrade
micromamba update pip=25.0               # pip upgrade to 25.0
micromamba update conda                  # conda upgrade

3. 가상환경 사용

-n 옵션으로 가상환경을 지정하고 생성/수정/삭제를 할 수 있고, 더불어 패키지를 함께 관리할 수 있다.

가상환경 생성

가상환경과 패키지를 함께 설치한다.

1

PS> mamba create -n myenv <list of packages>

가상환경에 python 버전을 지정할 수 있다.

1

PS> micromamba create -n myenv python=3.12

가상환경에 설치 채널을 지정해 설치할 수 있다. 아래는 conda-forge 채널 이용

1

PS> micromamba create -n myenv jupyterlab -c conda-forge python=3.12

1
2

# 가상환경 목록
PS> micromamba env list

가상환경 활성화

가상환경은 가상환경 이름을 주어 활성화 한다.

1
2

PS> micromamba activate myenv
(myenv) PS C:\Users\student>

혹은 가상환경이 있는 위치의 절대경로를 주어 활성화 할 수 있다.

1

PS> micromamba activate /path/to/myenv

run 명령은 가상환경을 사용해서 특정 스크립트/명령를 직접 실행할 수 있다.

1

PS> micromamba run -n myenv mycommand

가상환경 myenv 의 서버 목록을 출력

1
2
3
4
5

(myenv) PS> micromamba run -n myenv jupyter server list
Currently running servers:
http://localhost:8888/?token=317c9380f9c3ed4ab6f836a7ffbc789497728820e9c60f47 :: D:\Jupyter_Hub
http://localhost:8585/ :: D:\Jupyter_Hub
http://desktop-goyangi:8686/ :: D:\Jupyter_Hub

사용중인 가상환경 비활성화

1
2

(myenv) PS> micromamba deactivate
PS>

모듈/패키지 설치

micromamba 명령을 사용해 모듈과 패키지를 설치 채널을 지정해서 설치할 수 있다.

활성화 myenv 가상환경에서 matplotlib 패키지를 설치한다.

1
2
3
4
5
6
7

(myenv) PS>micromamba install matplotlib -c conda-forge
Pinned packages:
  - python=3.12
Transaction
  Prefix: C:\Users\student\micromamba\envs\myenv
...

비활성 상태에서 myenv 가상환경에 패키지를 설치한다.

1
2
3
4
5
6

PS> micromamba -n myenv install matplotlib
Pinned packages:
  - python=3.12

Transaction
  Prefix: C:\Users\student\micromamba\envs\myenv

가상환경 업데이트

특정 가상환경을 모두 업데이트

1

micromamba update -n myenv --all

환경의 모든 패키지를 덥데이트 하려면

1

micromamba update --all

가상환경 제거

설치한 가상환경을 지운다

1
2
3

PS> micromamba env remove -n myenv --all
...
Proceed ([y]/n)? y

4. Repoquery 명령

mamba 는 새로운 패키지 검색 명령으로 repoquery 명령을 선보이고 있다.

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16

# 설치 가능한 모든 python 패키지 목록
$ micromamba repoquery search python

# 설치 가능한 python=버전 패키지 목록
$ micromamba repoquery search "python>=3.11"

# 설치 가능한 jupyterlab 버전 패키지 목록
$ micromamba repoquery search "jupyterlab>=4.0"


# 현재 환경의 jupyterlab 에 연관된 의존성 패키지 목록
$ micromamba repoquery depends jupyterlab

# 현재 환경의 jupyterlab 에 연관된 모든 의존성 세부 목록
$ micromamba repoquery depends jupyterlab --recursive

패키지 연관 의존성을 트리형식으로 출력할 수 있다.

1
2
3
4
5
6
7
8

# 현재 환경의 jupyterlab 에 연관된 의존성 패키지의 트리 목록
$ micromamba repoquery depends -t jupyterlab
jupyterlab[4.3.4]
 ├─ jupyter-lsp[2.2.0]
  │  ├─ python already visited
  │  └─ jupyter_server[2.15.0]
  │     ├─ python already visited

And you can ask for the inverse, which packages depend on some other package (e.g. ipython) using whoneeds.

1
2
3
4
5
6
7
8

$ micromamba repoquery whoneeds ipython

Name            Version Build          Depends          Channel
-------------------------------------------------------------------
jupyter_console 6.4.3   pyhd3eb1b0_0   ipython          pkgs/main
ipykernel       6.9.1   py39haa95532_0 ipython >=7.23.1 pkgs/main
ipywidgets      7.6.5   pyhd3eb1b0_1   ipython >=4.0.0  pkgs/main
With the -t,--tree flag, you can get the same information in a tree.

트리 형식 출력

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17

$ mamba repoquery whoneeds -t ipython

ipython[8.2.0]
├─ jupyter_console[6.4.3]
│  └─ jupyter[1.0.0]
├─ ipykernel[6.9.1]
│  ├─ notebook[6.4.8]
│  │  ├─ widgetsnbextension[3.5.2]
│  │  │  └─ ipywidgets[7.6.5]
│  │  │     └─ jupyter already visited
│  │  └─ jupyter already visited
│  ├─ jupyter_console already visited
│  ├─ ipywidgets already visited
│  ├─ jupyter already visited
│  └─ qtconsole[5.3.0]
│     └─ jupyter already visited
└─ ipywidgets already visited

5. Uninstall, Windows

Micromamba는 Windows 11에서 다음과 같은 방법으로 삭제할 수 있습니다.

1. micromamba 설치 디렉토리 삭제:

micromamba가 설치된 디렉토리를 찾습니다. 일반적으로 C:\Users<사용자 이름>.local\bin 또는 C:\micromamba에 설치됩니다.
해당 디렉토리를 삭제합니다.

2. 환경 변수에서 micromamba 경로 제거:

Windows 검색 창에서 “환경 변수”를 검색하고 “시스템 환경 변수 편집”을 엽니다.
“시스템 속성” 창에서 “환경 변수” 버튼을 클릭합니다.
“시스템 변수” 섹션에서 “Path” 변수를 선택하고 “편집” 버튼을 클릭합니다.
micromamba가 설치된 디렉토리 경로가 있는지 확인하고, 있다면 해당 경로를 삭제합니다.
“확인” 버튼을 클릭하여 변경 사항을 저장합니다.

3. micromamba 관련 파일 삭제:

C:\Users<사용자 이름>.condarc 파일을 삭제합니다. (존재하는 경우)
C:\Users<사용자 이름>.mambarc 파일을 삭제합니다. (존재하는 경우)

C:\Users<사용자 이름>\AppData\Local\micromamba (존재하는 경우)

4. (선택 사항) micromamba 설치 시 생성된 바로가기 삭제:

micromamba 설치 시 생성된 바로가기가 있다면 삭제합니다.

5. (선택 사항) micromamba와 관련된 가상 환경 삭제:

micromamba를 사용하여 생성한 가상 환경이 있다면 해당 디렉토리를 삭제합니다. 가상 환경은 일반적으로 C:\Users<사용자 이름>.micromamba\envs 디렉토리에 저장됩니다.

참고

• Micromamba Installation
  • https://mamba.readthedocs.io/en/latest/installation/micromamba-installation.html
• Mamba
  • https://mamba.readthedocs.io/en/latest/user_guide/mamba.html
• VS-code 와 사용
  • https://github.com/mamba-org/vscode-micromamba

Sphinx 는 python의 대표적인 문서화 도구로 reStructedText 또는 Markdown 문서를 HTML, pdf, man page 등의 결과물로 생성할 수 있다.

sphinx 설치

sphinx 는 python 환경에서 실행이 된다. 설치는 python 환경 혹은 OS 환경에 직접 설치하는 방법이 있다. 파이썬 가상환경을 권장한다.

https://www.sphinx-doc.org/en/master/usage/installation.html

- Python 환경에 설치

python 환경 혹은 python 가상환경 (venv, virtualenv 등)에 설치

pip

1

pip install sphinx

Anaconda

1

conda install sphinx

- 시스템에 직접 설치

각 OS 의 SW 로 설치한다면 package 관리자를 사용해 설치한다.

Debian/Ubuntu

1

apt install python3-sphinx

RHEL, CentOS

1

yum install python-sphinx

macOS / home-brew

1

brew install sphinx-doc

Pandas 에서 2차원 data를 Stack, unstack, melt 를 이용해 복합 인덱스를 사용할 수 있고 Pivot 을 이용해 특정 데이터 중심의 2차원 데이터로 생성할 수 있다.

1. Pivot
2. Stack & Unstack
3. Melt

1
2

import pandas as pd
import numpy as np

2차원 테이블

행과 열로 구성된 데이터 집합

1
2
3
4
5
6
7

df = pd.DataFrame(
    {'foo' : ['One','One','One','Two','Two','Two'],
        'bar': ['A','B','C','A','B','C'],
        'baz': [1,2,3,4,5,6] ,
        'zoo': ['x','y','z','q','w','t']}
)
df

Pivot

피봇/피봇 테이블은 2차원 데이터 열에서 공통된 부분을 중심으로 새 테이블 집합을 형성하게 해준다. 피봇은 index, columns, values 라는 이름을 가진 세 가지 parameter를 취한다. 이러한 각 파라미터의 값으로 원래 표에 열 이름을 지정해야 한다.

foo, bar, baz, zoo 컬럼 중에서 foo 에 대해서 정리를 하고 bar 를 컬럼으로 지정하면 아래와 같다.

1
2

df_pivot = df.pivot_table(index='foo', columns='bar', values='baz')
df_pivot

ex) nba 데이터를 포지션의 연령별 연봉 테이블로 전환

1
2

dfnba = pd.read_csv('../data/nba.csv')
dfnba

1

pd.options.display.float_format = "{:,.2f}".format

컬럼의 데이터에 공통된 모습이 많이 보인다. 이 중에서 포지션을 기준으로 나이에 따른 연봉을 본다고 가정하면 포지션을 인덱스로하고 나이를 컬럼으로 지정하면 아래와 같다.

1
2

# 포지션의 연령별 연봉 테이블
dfnba.pivot_table(index='Position', columns='Age', values='Salary')

Stack & Unstack

2차원 테이블은 행 과 열이 순차적 값으로 교차하게 되어 있다. 스택은 컬럼의 값을 아래-위로 배치를 시킨다고 상상이 된다. 그래서 스택과 언스택은 이렇게 생각된다.

• stack : 2차원 컬럼의 내용을 수직방향으로 쌓는 구조, 즉 새로운 인덱스가 더해진다.
• unstack : 인덱스 구성요소를 한 단계 컬럼으로 만들며 수평방향으로 쌓게 한다.

stack

pandas reshaping

1
2
3
4
5
6
7

df_single_level = pd.DataFrame(
    [['Mostly cloudy', 10], ['Sunny', 12]],
    index=['London', 'Oxford'],
    columns=['Weather', 'Wind']
)
df_single_level

index와 weather, wind 라는 컬럼을 stack을 호출하면 weather-wind 관련 인덱스를 생성하고 데이터를 나열한다.

1

df_single_level.stack()

London  Weather    Mostly cloudy
        Wind                  10
Oxford  Weather            Sunny
        Wind                  12
dtype: object

다른 데이터를 살펴보자.

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12

# MultiIndex
tuples = list(
    zip(
        *[
            ["bar", "bar", "baz", "baz", "foo", "foo", "qux", "qux"],
            ["one", "two", "one", "two", "one", "two", "one", "two"],
        ]
    )
)
index = pd.MultiIndex.from_tuples(tuples, names=["first", "second"])
df = pd.DataFrame(np.random.randn(8, 2), index=index, columns=["A", "B"])
df

위 데이터는 stack()을 하면 A, B 컬럼이 MultiIndex 로 추가되며 A, B 컬럼 데이터 포인트가 배치된다.

1

df.stack()

first  second   
bar    one     A   -1.301694
               B   -0.013259
       two     A   -0.197846
               B    0.879890
baz    one     A    0.718211
               B   -0.739434
       two     A   -0.140217
               B    0.071260
foo    one     A   -1.142268
               B   -2.606413
       two     A    1.119145
               B    0.109402
qux    one     A   -0.504167
               B   -1.703280
       two     A    1.064976
               B    1.011060
dtype: float64

1
2

df2 = df[:4]
df2

1
2

stacked = df2.stack()
stacked

first  second   
bar    one     A   -1.301694
               B   -0.013259
       two     A   -0.197846
               B    0.879890
baz    one     A    0.718211
               B   -0.739434
       two     A   -0.140217
               B    0.071260
dtype: float64

Unstack

pandas reshaping

1

stacked

first  second   
bar    one     A   -1.301694
               B   -0.013259
       two     A   -0.197846
               B    0.879890
baz    one     A    0.718211
               B   -0.739434
       two     A   -0.140217
               B    0.071260
dtype: float64

1

stacked.unstack()

레벨을 지정

1

stacked.unstack(1)

1

stacked.unstack(2)

1

Melt

melt() 는 ID 변수를 기준으로 원래 데이터셋에 있던 여러개의 칼럼 이름을 ‘variable’ 칼럼에 위에서 아래로 길게 쌓아놓고, ‘value’ 칼럼에 ID와 variable에 해당하는 값을 넣어주는 식으로 데이터를 재구조화합니다.

1
2
3
4
5
6
7
8
9

cheese = pd.DataFrame(
    {
        "first": ["John", "Mary"],
        "last": ["Doe", "Bo"],
        "height": [5.5, 6.0],
        "weight": [130, 150],
    }
)
cheese

1
2

# colums중 height, weight 를 row 로 융합
cheese.melt(id_vars=['first','last']) # first, last 인덱스로 나머지 컬럼은 value 로 치환

1

cheese.melt(id_vars=['first','last'], value_name='quantity') 

1

참고

1. pandas.DataFrame.stack

numpy 와 pandas 에서 수를 출력할 때 형식, 크기 및 범위를 설정할 수 있다. 간단히 보면 아래 테이블 같이 형식을 바꿔준다.

아래 요약한 옵션 방법을 사용해서 Numpy 와 Pandas에 있는 숫자를 출력할 때 표현방법, 표기법, 환률, 정밀도 등을 변경해 사용할 수 있다

numpy 출력 형식 변경

numpy 숫자 출력 형식 변경

numpy.set_printoptions 을 사용할 수 있다.

1
2

numpy.set_printoptions(precision=None, threshold=None, edgeitems=None, linewidth=None, suppress=None,
                       nanstr=None, infstr=None, formatter=None, sign=None, floatmode=None, *, legacy=None)

현재 출력형식 확인

np.get_printoptions() 으로 현재 상태를 출력할 수 있다.

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13

> np.get_printoptions()
{'edgeitems': 3,
 'threshold': 1000,
 'floatmode': 'maxprec',
 'precision': 8,
 'suppress': False,
 'linewidth': 75,
 'nanstr': 'nan',
 'infstr': 'inf',
 'sign': '-',
 'formatter': None,
 'legacy': False
}

Numpy 에서 실수 Float 의 출력 형식을 바꾸는 몇가지 사례를 보자

- formatter 이용

1
2

import numpy as np
np.set_printoptions(formatter={'float_kind': lambda x: "{0:0.3f}".format(x)})

- precision 이용

1
2
3

> np.set_printoptions(precision=4)
> np.array([1.123456789])
[1.1235]

- threshold 이용

개수가 많은 아이템을 출력할 때 요약해 출력할 수 있다.

1
2
3

> np.set_printoptions(threshold=5)
> np.arange(10)
array([0, 1, 2, ..., 7, 8, 9])

numpy.printoptions 사용

numpy.printoptions 를 with 구문과 함께 사용해 제한된 출력 조정을 할 수 있다.

출력시 printoptions 를 with 구문과 사용할 수 있다. set_printoptions 의 인자를 동일하게 적용할 수 있다

• precision, threshold, edgeitems, linewidth, suppress, nanstr, infstr, formatter, sign, floatmode

1

numpy.printoptions(*args, **kwargs)[source]

소수점 출력 변경

1
2
3
4
5
6

> np.array([2.0]) / 3
array([0.66666667])


> with np.printoptions(precision=3):
>    print( np.array([2.0]) / 3 )

pandas 숫자 출력 형식 변경

pandas에서 몇 가지 옵션을 바꾸는 방법을 정리해 보자. pandas의 옵션은 pd.options 를 사용한다.

pd.options.display

출력의 형태, 표기를 변경하는 것은 pd.options.display 아래에 있다. 여기서 사용할 수 있는 옵션은 describe_option() 으로 확인할 수 있다.

1
2
3
4
5
6
7

> pd.describe_option()
compute.use_bottleneck : bool
    Use the bottleneck library to accelerate if it is installed,
    the default is True
    Valid values: False,True
    [default: True] [currently: True]
  ...

- row, column 출력 개수 조정

• pd.options.display.max_rows : 표를 출력할 때 최대 행 수입니다.
• pd.options.display.min_rows : 표를 출력할 때 최소 행 수입니다.

1
2
3
4
5

import pandas as pd
> pd.options.display.max_rows
60
> pd.options.display.min_rows
10

min_row, max_row에 직접 대입하면 해당 옵션의 현재 값이 변경된다.

1
2
3

> pd.options.display.min_rows=100
> pd.options.display.min_rows
100

max_rows에 값을 입력하면 테이블의 최대 행수를 바꿀 수 있다.

^{이미지 참조 1}

1
2
3

> pd.options.display.max_rows = 100
> pd.options.display.max_rows
100

- pd.get_option(), pd.set_option() 함수

pd.get_option() 함수를 이용해서 옵션인자에 대한 정보를 확인할 수 있다.

1
2

> pd.get_option('min_rows')
100

get_option은 옵션 이름의 일부만 일치해도 된다.

1
2

> pd.get_option('min_r')
100

max_rows 수를 설정한다. set_option도 일부만 일치해도 된다.

1
2
3
4
5
6

> pd.set_option('max_rows', 20)
> pd.options.display.max_rows
20
> pd.set_option('max_r', 50)
> pd.options.display.max_rows
50

- 컬럼의 폭 조정

display.max_colwidth 는 보통 50~70자 정도 정해져 있다. 컬럼에 표시되는 텍스트가 50자가 넘으면 ... 줄임 표시가 나타난다.

1
2

> pd.options.display.max_colwidth
50

- chop_threshold

chop_threshold 는 값의 크기 한계를 지정해서 이 값보다 작은 수는 모두 0으로 표시한다.

1
2
3
4
5
6

> pd.options.display.chop_threshold = 0.99
> pd.DataFrame({'x': [10, 1, 0.1]})
> print(x)
0	10.0
1	1.0
2	0.0

숫자 포매팅

다양한 사례는:

• https://pandas.pydata.org/docs/user_guide/options.html#number-formatting

- float_format

float_format 는 실수 값을 출력시 소수점의 출력의 정밀도를 조정할 수 있다. 아래 람다 함수 lambda x: f'{x:.1f} 는 실수 x를 받아 소수점 첫째 자리까지 출력해 준다.

1
2
3
4

> pd.options.display.float_format = lambda x: f'{x:.1f}'
> pd.DataFrame({'x': [3.141592]})
x
0	3.1

또한 set_option 을 사용할 수 있다.

1

> pd.set_option('display.float_format', '{:.2f}'.foramt )

금액 단위에 사용하는 천단위 구분을 위해서 {:,.2f} 형식을 사용하면 화폐 단위를 추가하고 천단위 구분자를 추가해 주고 소수점 2자리수 정밀로를 지정한다.

1
2
3
4
5

> pd.set_option('display.float_format', '${:,.2f}'.format )
> pd.DataFrame({'x': [10000000.0, 34589234.4]})
  x
0 $10,000,000.00
1 $34,589,234.40

- precision

실수의 소수점은 precision 로 과학적 표기법으로 변환할 자릿수를 지정한다. 아래와 같이 하면 소수점 셋째 자리 밑으로는 과학적 표기법으로 표시합니다.

1
2
3
4

> pd.options.display.precision = 3
> pd.DataFrame({'x': [0.5], 'y': [0.0005]})
x	y
0	0.5	5.000e-04

과학적 표기법으로 3.000e-04는 3.000 이다. 자릿수가 아주 작거나 큰 수를 표기할 때 유용합니다.

- 설정 초기화 reset_option()

설정을 초기화할 때 사용한다.

1
2
3
4

# chop_threshold 옵션 초기화
pd.reset_option('display.chop_threshold')
# float_format 옵션 초기화
pd.reset_option('display.float_format')

- 옵션 설명 describe_option()

pd.describe_option(OPTIONS) 를 사용하면 해당 옵션에 대한 설명을 출력해 준다.

1
2
3
4
5

> pd.describe_option("max_rows")
display.max_rows : int
    If max_rows is exceeded, switch to truncate view. Depending on
    `large_repr`, objects are either centrally truncated or printed as
    a summary view. 'None' value means unlimited.

참고

1: Try These Pandas Display Configurations

2: Pandas options

파이썬에서 작업한 소스를 공개/비공개 배포하기 위해서 패키징을 하는 방법을 요약, 정리했다.

파이썬 모듈 배포하기

이 글은 setuptools, builds 그리고 PyPI 업로드를 위한 twine 를 사용하고 있다.

[핵심 용어]

• PyPi, Python Package Index: 파이썬 사용자를 위한 오픈소스 패키지의 공개 저장소 일명 PyPi
• PyPa, 파이썬 패키징 위원회: 표준 패키징 도구/메타 데이터/파일 형식 표준을 GitHub 와 Bitbucket 을 통해서 여러 패키징 도구, 문서, 이슈 추적기를 관리하고 있다.
• distutils: 1998년/파이썬 표준 라이브러리 최초의 빌드 및 배포 시스템. 대부분 직접 사용이 단계적으로 폐지되고 있다.
  • distutils는 파이썬 3.10부터 deprecated, 3.12에서 삭제될 예정.
• setuptools : 2004 공개/ distutils 의 드롭인(drop-in) 대체품. distutils 와 큰 차이는 다른 패키지에 대한 의존성을 선언할 수 있다.
• [pyproject.toml]: 2016년 setuptools의 메타 파일 setup.py 의존성을 피하고자 독립한 빌드용 선언적 메타정보 파일.
• wheel: distutils/setuptools 에 bdist_wheel 명령을 추가하는 프로젝트이다. 파이썬 라이브러리를 바이너리 확장을 포함/크로스 플랫폼 바이너리 패키징 형식 지원 (“휠”,”휠 파일”, PEP 427 정의).

도구 설치

setuptools 기반 배포도구 설치

1

python -m pip install setuptools wheel twine

파이썬 패키징

https://packaging.python.org/en/latest/tutorials/packaging-projects/ 내용을 요약, 정리, 보충한다.

프로젝트 생성

패키징 수행하면 별도의 가상환경을 생성해서 진행한다.

프로젝트를 패키징하는 과정을 위해서 packaging_tutorial 폴더 아래에 같은 구조를 갖는다.

1
2
3
4
5

packaging_tutorial/
└── src/
    └── example_package_YOUR_USERNAME_HERE/
        ├── __init__.py
        └── example.py

• example_package_YOUR_USERNAME_HERE : 프로젝트 이름이고 중복하지 않게 한다.
• __init__.py : 빈 파일로 폴더를 패키지로 인식하게 한다.
• example.py : 모듈.

example.py 모듈 소스.

1
2

def add_one(number):
    return number + 1

패키징용 파일 생성

배포를 위한 프로젝트의 구성을 위해 패키징에 필요한 파일을 추가한 구조는 아래 같다.

1
2
3
4
5
6
7
8
9

packaging_tutorial/
├── LICENSE
├── pyproject.toml
├── README.md
└── src/
│   └── example_package_YOUR_USERNAME_HERE/
│       ├── __init__.py
│       └── example.py
└── tests/

• LICENSE : 라이센서 선언
• pyproject.toml : 프로젝트 배포 프로젝트 생성에 사용하는 프론트엔드 빌드도구 pip, 백엔드 밸드도구 build
• README.md
• tests/ : 테스트 파일용 공간. Leave it empty for now.

패키징의 프론트엔드, 백엔드는 참조의 5번 항목을 살펴보자.

pyproject.toml 구성

보통 파일 내용은 아래 항목으로 구성한다. 이 파일은 TOML 형식의 구조를 따르고 있다. 여기에 대해서는 아래 참조 4번 항목 내용을 보기 바란다.

1
2
3
4
5
6
7
8
9

[build-system]
...

[project]
...

[project.urls]
...

빌드 도구를 명시하는 명세서 pyproject.toml에 setuptools 를 사용한 예이다.

1
2
3

[build-system]
requires = ["setuptools>=61.0"]
build-backend = "setuptools.build_meta"

• requires : 빌드용 도구 지시.
• build-backend : 프론트엔드 (pip)에서 빌드에 사용하는 백엔드 도구

다음은 Hatching 이란 빌드 도구를 사용한 예이다.

1
2
3

[build-system]
requires = ["hatchling"]
build-backend = "hatchling.build"

메타 정보를 포함한 간단한 pyproject.toml 구성 결과.

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22

[build-system]
requires = ["setuptools>=61.0"]
build-backend = "setuptools.build_meta"

[project]
name = "example_package_YOUR_USERNAME_HERE"
version = "0.0.1"
authors = [
  { name="Example Author", email="author@example.com" },
]
description = "A small example package"
readme = "README.md"
requires-python = ">=3.7"
classifiers = [
    "Programming Language :: Python :: 3",
    "License :: OSI Approved :: MIT License",
    "Operating System :: OS Independent",
]

[project.urls]
"Homepage" = "https://github.com/pypa/sampleproject"
"Bug Tracker" = "https://github.com/pypa/sampleproject/issues"

자세한 메타 정보 내역은 프로젝트 메타정보 정의를 참조한다. 주요 메타 정보의 인자:

• [project]:
  • requires-python : 패키지가 요구하는 최소 파이썬 버전 명시
  • classifiers: pip가 인지하는 패키지에 대한 정보

README.md / LICENSE 파일

README.md 파일에 패키지 모듈를 설명한다.

1
2
3
4
5

# Example Package

This is a simple example package. You can use
[Github-flavored Markdown](https://guides.github.com/features/mastering-markdown/)
to write your content.

LICENSE 파일에 저작권을 명시한다.

1
2
3

Copyright (c) 2018 The Python Packaging Authority

Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy

배포 묶음 생성하기

배포를 위한 build 도구를 설치한다.

1

python3 -m pip install --upgrade build

packaging_tutorial 폴더 아래 pyproject.toml 파일이 있는 위치에서 배포를 위한 build 명령으로 소스를 패키징을 한다.

build 를 수행하면 별도의 venv 가상환경을 생성해서 의존성에 명시된 setuptools 등을 설치하고 빌드를 진행한다.

1
2
3
4
5
6
7

> python3 -m build
* Creating venv isolated environment...
* Installing packages in isolated environment... (setuptools>=61.0)
...
...
removing build\bdist.win-amd64\wheel
Successfully built example_package_YOUR_USERNAME_HERE-0.0.1.tar.gz and example_package_YOUR_USERNAME_HERE-0.0.1-py3-none-any.whl

이 명령의 결과로 dist 폴더에 우리 프로젝트에 대한 배포용 패키징으로 소스 패키징 .gz 파일, built distribution 패키징 .whl 2개의 파일이 생성된다.

1
2
3

dist/
├── example_package_YOUR_USERNAME_HERE-0.0.1-py3-none-any.whl
└── example_package_YOUR_USERNAME_HERE-0.0.1.tar.gz

pip 로 wheeels 설치하기

pip 에서 built distribution 파일을 직접 설치할 수 있다. installing-from-wheels 참조.

다음은 우리 프로젝트의 wheel 패키징을 설치한다.

1

python -m pip install example_package_YOUR_USERNAME_HERE-0.0.1-py3-none-any.whl

혹은 provides_extras 메타 정보를 사용해 추가 설치를 한다면,

1

python -m pip install './somepackage-1.0-py2.py3-none-any.whl[my-extras]'

Upload

처음 PyPi 에 업로드를 하려면 아래 2가지 단계를 거쳐서 진행해 본다.

1. https://test.pypi.org/account/register/ 에서 등록
   1. 실제 pypi 가 아닌 튜토리얼과 테스트를 위한 곳.
2. PyPi 업로드를 완성하려면 PyPI API token 을 발급받아야 한다.
   1. https://test.pypi.org/manage/account/#api-tokens

PyPI에 업로드가 완료되면 pip 를 통해서 패키지를 설치할 수 있다. 업로드를 위해서 Twin 패키지를 설치하고 사용해야 한다.

1

python3 -m pip install --upgrade twine

twine 모듈을 사용해서 dist/ 아래의 모든 소스/휠 패키징 묶음을 업로드할 수 있다. 지금은 testpypi 에 업로드를 해보자.

1

python3 -m twine upload --repository testpypi dist/*

• 업로드시 username은 __token__ 사용.
• 패스워드는 발급받은 pypi- 으로 시작하는 token 값.

업로드 진행은 아래 같을 것이다.

1
2
3
4
5
6
7

Uploading distributions to https://test.pypi.org/legacy/
Enter your username: __token__
Uploading example_package_YOUR_USERNAME_HERE-0.0.1-py3-none-any.whl
100% ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ 8.2/8.2 kB • 00:01 • ?
Uploading example_package_YOUR_USERNAME_HERE-0.0.1.tar.gz
100% ━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━━ 6.8/6.8 kB • 00:00 • ?

여기서 repository로 testpypi 를 지정했으므로 업로드한 결과는 다음 같이 확인할 수 있다.

• https://test.pypi.org/project/example_package_YOUR_USERNAME_HERE

저장소에서 설치하기

위에 testpypi 에 업로드한 패키지를 설치하려면 아래 같이 --index-url 로 저장소를 지정해서 사용한다.

1

python3 -m pip install --index-url https://test.pypi.org/simple/ --no-deps example-package-YOUR-USERNAME-HERE

PyPI 에 업로드

마지막으로 실제 패키지를 PyPI에 업로드하려면 https://pypi.org 등록을 하고, 등록한 사용자 아이디를 사용하고 --repository 인자를 제외하고 업로드하면 된다.

1

python3 -m twine upload dist/*

통합 메타 정보로서 pyproject.toml 활용

테스트, 코드 포맷팅 등에 대한 정보로 활용한다. 대표적으로는 코드 포맷팅 도구인 black, 테스트용 프레임워크인 pytest 등이 pyproject.toml에 설정 값을 저장하고 있다 - 파이썬 패키징의 역사, blog

1
2
3
4
5

# pyproject.toml of black
[tool.black]
line-length = 88
target-version = ['py36', 'py37', 'py38']
include = '\.pyi?$'

다음

이후에 다른 빌드 도구들, 테스트 도구들을 다뤄보자.

• poetry:
  • Poetry를-사용하여-가상환경-만들기
  • poetry를 사용한 파이썬 dependency관리

참고

1. 파이썬 모듈 배포하기, python.org
2. Tool recommendations, python.org
   1. 주요 패키징에 필요한 도구 안내
3. 파이썬 패키징의 역사, blog
4. TOML의 이해와 기본 활용, itworld
5. Python package의 build frontend 와 backend

크롤링, 데이터 베이스 연결등에 사용자 인증번호를 사용하는데 코드 자체에 아이디/비밀번호를 입력해서 사용하면 유출의 염려가 있으므로 이를 외부 파일에 두고 관리하고자 한다.

여러가지 방법이 있겠지만 여기서는 json 을 사용한다.

key:value 형식의 properties, 윈도우 ini 같은 형식을 지원하는 configparser 모듈도 좋은 선택 같다.

json 이용 키 관리

외부에 아래 형식의 secret 파일을 생성한다.

• 디렉토리: .api_keys/ 폴더 사용
• 파일: secret_keys.json

secret_keys.json

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15

{   "naver.com" : {
        "userid": "UR_ID",
        "password" :"votmdnjem" },
    "apple.net": {
        "userid": "UR_ID",
        "password" : "votmdnjem" },
    "api.twitter.com": {
        "CONSUMER_KEY" : "unJgTOc0aZkk7NoX4LlD5g",
        "CONSUMER_SECRET":"uHdmctDcPM66s9OasrKnr2x3pu88",
        "ACCESS_TOKEN" : "98948674-J9auHiBiOGoWUJOzRafp",
        "ACCESS_TOKEN_SECRET" : "kKgT9tlSY2rCIAbWJrCEEiTsR37" },
    "my_database" : {
            "userid" : "UR_ID",
            "password" : "votmdnjem"}
}

파일 사용

json 모듈을 사용해서 해당 파일을 읽으면 키:값 형식으로 참조해서 사용할 수 있다.

1
2
3
4

import json

with open('../../.api_keys/secret_keys.json') as f:
    secrets = json.loads(f.read())

이렇게 읽어들인 json 은 dict 같이 사용할 수 있다.

1

DB_USER, DB_PW = secrets['my_database']['userid'], secrets['my_database']['password']

회사 등에서 방화벽을 사용하는 경우 pip / conda 저장소에서 패키지 설치가 안되는 경우가 있다. 또한 방화벽 안에서 설치할 경우 SSL verification error 에러 발생으로 설치가 안되기도 한다. 이런 경우 직접 pip 혹은 conda 설치가 안되는 경우에 프락시 지정을 해서 사용이 가능하다.

conda proxy

.condarc 파일과 conda 명령 옵션으로 사용할 수 있다.

.condarc 파일

사용자 홈디렉토리 .condarc 파일에 proxy 구성을 한다.

• Using the .condarc conda configuration file

파일에 proxy_servers 구성해 사용한다.

1
2
3

proxy_servers:
     http: http://IP_ADDRESS:8080
     https: https://IP_ADDRESS:8080

ssl_verify: SSL verification error

방화벽 때문에 파이썬 패키지를 설치할 때 SSL 인증 오류(SSL verification error)가 생겨 곤란할 때가 있다. 만약 프락시 인증서가 필요하면 pip 인증서를 추가하면 ssl verification 에러를 피할 수 있다.

1
2
3
4

proxy_servers:
     http: http://IP_ADDRESS:8080
     https: https://IP_ADDRESS:8080
ssl_verify: %programdata%\pip\dscert.crt

conda --set 옵션 사용

설정 파일 대신 conda 명령에서 --set 옵션을 사용하면 설정 파일을 편집해서 저장이 된다.

1

conda config --set [설정내용]

다음은 ssl_verify 에 pip 인증서를 추가하거나 False 로 제외하고 사용하고 있다.

1

conda config --set ssl_verify False

명령에서 즉시 사용할 때는 --add 옵션을 사용한다.

pip proxy

pip 명령은 명려에서 옵션 pip proxy 옵션을 사용하거나 설정 파일 pip.ini 로 구성할 수 있다.

• pip Configuration

pip.ini

pip는 사용자 구성에서 아래 같이

• 윈도우: %HOMEPATH%\pip\pip.ini
• 리눅스/맥: $HOME/.pip/pip.conf

trusted-host 를 구성해 준다.

1
2
3
4
5
6

[global]
proxy=http://IP_ADDRESS:8080
trusted-host = pypi.python.org
               pypi.org
               files.pythonhosted.org

ssl cert

SSL 의 경우 cert 옵션을 사용할 수 있다.

1
2
3
4
5
6

[global]
cert=C:\Users\user\pip\cert.crt
proxy=http://IP_ADDRESS:8080
trusted-host = pypi.python.org
               pypi.org
               files.pythonhosted.org

pip 명령 사용

명령으로 직접 proxy 를 지정할 수 있다.

1

pip install --proxy https://{proxy}:{port} {BINARY}

다음 같인 trusted-host 등도 지정 할 수 있다.

1

pip install --upgrade --proxy https://IP_ADDRESS:8080 --trusted-host pypi.python.org --trusted-host pypi.org --trusted-host files.pythonhosted.org matplotlib numpy openpyxl xlrd xlwt pandas